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拦截的短信被删除后是否能恢复，取决于具体情况。可以尝试以下几种方法。
1、如果开启了iTunes备份，那么可以通过iTunes备份恢复被删除的短信。
2、使用专业的数据恢复软件如开心手机恢复大师进行扫描，也有机会找回删除的短信。
3、如果短信被拦截后在短信垃圾箱里又被删除，那么可能无法直接在手机系统中找回，不过可以尝试使用第三方软件来扫描手机缓存数据，可能会有一些残留的数据片段可以恢复，但这种方法并不能保证一定能找回所有删除的短信。
如果以上方法都无法找回删除的短信，那么可能需要接受数据已经永久删除的事实，请注意在尝试恢复数据时，保护好个人隐私，避免泄露重要信息。
仅供参考，建议根据实际情况选择合适的方法进行操作。